Algunos de los órganos y sistemas en los cuales tiene participación el sistema autónomo o vegetativo son los siguientes:
1. Visión: rige la apertura de la pupila y la capacidad de enfocar la mirada, conectando con los músculos del iris y del conjunto del ojo.
2. Corazón y vasos sanguíneos: El latido del corazón y la presión sanguínea se dan de forma inconsciente. De este modo, nos mantienen con vida segundo a segundo.
3. Pulmones: la respiración también está controlada por el sistema nervioso autónomo.
4. Tubo digestivo: el proceso por el cual el tubo digestivo transforma el alimento, mediante el conjunto de actuaciones que el organismo realiza durante la digestión, es involuntario y regido por parte del sistema nervioso autónomo.
5. Genitales: el sistema autónomo rige procesos relacionados con el acto sexual. Además, estos procesos se complican cuando se experimenta una sensación de miedo o ansiedad, algo que lo vincula con varios estados fisiológicos.
6. Secreción de enzimas y de residuos: La producción y expulsión de lágrimas, sudor, orina y heces fecales se debe y/o puede alterarse en parte debido al funcionamiento del sistema nervioso autónomo. Lo mismo ocurre con la secreción de enzimas digestivas y saliva.
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